Projekti juhtimisstruktuur on formaalsete koostöösuhete skeem, mis kujutab endast koostisosade paigutusest ja nende omavahelistest seostest tulenevat eripärast põimikut või mustrit.

Projektorganisatsiooni ametlik ülesehitus esindab ametikohti ja nende rühmitusi (allüksusi), mille seovad üheks kogumiks nendevahelised ametlikud õigusseosed. Ülesehitus aitab paremini mõista organisatsiooni olemust ja osa ning temaga seonduvaid probleeme.

Projektide korral eristatakse:

• puhast projektorganisatsiooni
• maatriks projektorganisatsiooni ja
• projekti koordineerimist.

Puhta projektorganisatsiooni korral luuaks projekt ettevõtte juurde nii, et ta ei puuduta ettevõtte seniseid funktsioone või tegevusvaldkondi.

Maatriks projektorganisatsiooni korral luuakse projekt ettevõtte juurde nii, et projektgrupp koostatakse firma olemasolevate töötajate baasil.

Projektide koordineerimise korral luuakse projektide läbiviimiseks pidevalt muutuvad töörühmad. Töösse haaratakse töötajad lühiajaliselt sellest allüksusest, kus on olemas konkreetse ülesande lahendamiseks sobiv oskusteave.